Основное направление деятельности хозяйствующих субъектов СЭЗ «Нукус» — производство широкого спектра высокотехнологичной, конкурентоспособной на мировых рынках продукции за счёт внедрения современного зарубежного высокопроизводительного оборудования и техники, технологических линий и модулей, инновационных технологий.
На территории СЭЗ созданы все условия для создания промышленных комплексов с полным циклом производства от сырья до готовой продукции.
Исходя из концепции создания СЭЗ «Нукус», на его территории размещаются предприятия по производство лекарственных изделий